El municipio de Medio San Juan se encuentra localizado en la región Pacífica Colombiana, en el departamento del Chocó.
Medio San Juan es un municipio de Colombia, situado en el noroeste del país en el departamento de Chocó.
Se sitúa a 75 km de la capital departamental, Quibdó. El municipio limita por el norte con Istmina y Condoto, por el sur con Istmina por el este con Nóvita y Condoto, y al oeste con Istmina. Fue convertido en municipio el 20 de julio de 2000.
Se concibe al Municipio Medio San Juan, Como un ente territorial con presupuesto común entre todas sus poblaciones, con el propósito de utilizarlos eficiente y eficazmente, para obtener una organización que beneficié a la comunidad y se logren los objetivos propuestos.
Su cabecera municipal está compuesta por los siguientes barrios: Porvenir, Comercio, San José, Guarapito, El Llano, El Centro, Palmeras, La Punta, La Barca, La Virgen, Villa España.
